스탠퍼드 연구진의 Paper2Agent는 논문과 코드를 분석해 실행 환경을 만들고, 튜토리얼을 시험한 뒤 MCP 도구로 노출하는 자동화 체계를 제시했다. 생물학 논문 100편을 대상으로 74개 에이전트를 만들었고, 검증 대상 도구 599개 중 593개가 통과했다. 질의 300개 평가에서는 91.2%의 성공률을 보고했다. 다만 실패한 변환을 제외하는 절차와 재시도, 수치 허용오차가 포함된 평가이므로 모든 논문을 그대로 재현한다는 뜻은 아니며, 결과 해석과 과학적 타당성 확인은 남는다.